Das Projekt VICE (Virtual Open Science Collaboration Environment) unterstützt Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler unterschiedlicher Fachdisziplinen beim Aufbau und der Anpassung virtueller Forschungsumgebungen. Hierbei soll als wichtige Basisinfrastruktur eine übergreifende Kollaborations-Plattform entstehen, durch die eine langfristige Nachnutzung von Forschungsergebnissen besonders im Hinblick auf neue Fragestellungen in der Wissenschaft gewährleistet werden kann.
Ziel hierbei ist, es den Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern zu ermöglichen, unterschiedliche Versionsstände ihrer virtuellen Forschungsumgebungen und Forschungsdaten prozessbegleitend dokumentieren und auch anderen Forscherinnen und Forschern zur Verfügung stellen zu können. Die Plattform wird gemeinsam mit den Infrastrukturpartnern Freiburg, Tübingen und Mannheim (HPC, bwCloud, bwLehrpool) exemplarisch für die Fach-Communities Anglistik, Wirtschaftsinformatik, Lebenswissenschaften und Teilchenphysik bereitgestellt. Als wissenschaftlicher Dienst soll sie auch weiteren Disziplinen langfristig zur Verfügung stehen und in der Lehre und Integration des wissenschaftlichen Nachwuchses zum Einsatz kommen.

Berichte

Diskussion von Betriebsmodellen für große Forschungsinfrastrukturen an (Universitäts-)Rechenzentren
Projekt “ViCE” Arbeitspaket AP3 Task 2
Autoren: Dirk von Suchodoletz, Janne Chr. Schulz 2018, 2019

Diskussion von möglichen Geschäftsmodellen für Forschungsinfrastrukturen
Projekt “ViCE” Arbeitspaket AP3 Task 2
Autoren: Dirk von Suchodoletz, Janne Chr. Schulz Erste Version März 2017; ergänzt, finalisiert Feb. 2019

Publikationen

Jan Leendertse und Dirk von Suchodoletz: Kosten und Aufwände von Forschungsdatenmanagement. In: Bausteine Forschungsdatenmanagement 1-2020, S. 1-7, DOI 10.17192/bfdm.2020.1.8246

Felix Bartusch; Kolja Glogowski; Ulrich Hahn; Michael Janczyk; Steve Kaminski; Jens Krüger; Volker Lutz; Gerhard Schneider; Mark Seifert; Dirk von Suchodoletz; Thomas Walter und Bernd Wiebelt: Defining the future scientific data flow formulti-disciplinary research data, In: E-Science-Tage 2019: Data to Knowledge, Hrsg. von  Heuveline, Vincent; Gebhart, Fabian und Mohammadianbisheh, Nina 2020-03, Heidelberg: heiBOOKS.

Dirk von Suchodoletz; Jonathan Bauer; Oleg Zharkov; Susanne Mocken und Björn Grüning: Lessons learned from Virtualized Research Environments in today’s scientific compute infrastructures. In: E-Science-Tage 2019: Data to Knowledge. Hrsg. von Heuveline, Vincent; Gebhart, Fabian und Mohammadianbisheh, Nina. Heidelberg: heiBOOKs 3-2020.

Dirk von Suchodoletz und Jonathan Bauer: ViCE – Creating Uniform Approach to Large-Scale Research Infrastructures. In: E-Science-Tage 2019: Data to Knowledge. Hrsg. von Heuveline, Vincent; Gebhart, Fabian und Mohammadianbisheh, Nina. Heidelberg: heiBOOKs 3-2020.

Bauer, Jonathan / Rettberg, Simon / Ritter, Steffen / Rößler, Christian / Suchodoletz, Dirk von / Münchenberg, Jan: “bwLehrpool – a jointly managed and financed inter-university IT project”. (Eingereicht für: 12. DFN-Forum Kommunikationstechnologien im Januar 2019).

Hauser, C.B. / Domaschka, J. / Wesner, S. (2018, July): Predictability of Resource Intensive Big Data and HPC Jobs in Cloud Data Centres. In: 2018 IEEE International Conference on Software Quality, Reliability and Security Companion (QRS-C)(pp. 358-365).

Hauser, C. B. / Wesner, S. (2018, July): Reviewing Cloud Monitoring: Towards Cloud Resource Profiling. In 2018 IEEE 11th International Conference on Cloud Computing (CLOUD) (pp. 678-685).

Lafayette, Lev / Wiebelt, Bernd (2017): Spartan and NEMO: Two HPC-Cloud Hybrid Implementations. 2017 IEEE 13th International Conference on e-Science (e-Science), 458 - 459.

Mair, Christian (2018): "Erfolgsgeschichte Korpuslinguistik? Überlegungen zum Fortschritt in der Sprachwissenschaft." In: Marc Kupietz & Thomas Schmidt, eds. Korpuslinguistik. Germanistische Sprachwissenschaft um 2020, 5. Berlin: de Gruyter. 5-25.

Afgan, E. et al.(2018) The Galaxy platform for accessible, reproducible and collaborative biomedical analyses: 2018 update. In: Nucleic Acids Research, 46.

Batut, B. et al.(2018): Community-Driven Data Analysis Training for Biology. In: Cell Systems, 6, 752–758.e1.

Grüning, B. et al.(2018): Bioconda: sustainable and comprehensive software distribution for the life sciences. In: Nature Methods, 15, 475–476.

Grüning, B. et al.(2018): Practical Computational Reproducibility in the Life Sciences. In: Cell Systems, 6, 631–635.

Grüning, B. A. et al.(2017): Jupyter and Galaxy: Easing entry barriers into complex data analyses for biomedical researchers. In: PLoS Comput Biol, 13, e1005425.

Janczyk, Michael / Wiebelt, Bernd / Suchodoletz, Dirk von (2017): Virtualized Research Environments on the bwForCluster NEMO. In: Proceedings of the 4th bwHPC Symposium October 4th, 2017, Alte Aula Eberhard Karls Universität Tübingen, 37-40.

Leendertse, Jan, Susanne Mocken, und Dirk von Suchodoletz. 2019. „Datenmanagementpläne Zur Strukturierung Von Forschungsvorhaben“. Bausteine Forschungsdatenmanagement, Nr. 2 (Mai), 4-9. https://doi.org/10.17192/bfdm.2019.2.8003

Suchodoletz Dirk von / Schulz, Janne Chr. / Leendertse, Jan (2017): Abstraktion erlaubt neue Aufgabenverteilung – Virtualisierung, Clouds und die zukünftige Rolle wissenschaftlicher Rechenzentren. In: Wissenschaftsmanagement (4), 31-35.

Suchodoletz, Dirk von / Schulz, Janne Chr. / Leendertse, Jan (2017): Vom wissenschaftlichen Rechenzentrum zum Rechenzentrum für die Wissenschaft – Überlegungen zur Rekalibrierung von IT-Strategien an Universitäten und Hochschulen. In: Wissenschaftsmanagement (5/6), 30-35.

Lafayette, Lev / Wiebelt, Bernd / Suchodoletz, Dirk von / Rasche, Helena / Janczyk, Michael / Tosello, Daniel (2019): The Chimera and the Cyborg - Invivo Hybrid Compute: HPC, Cloud, and Container Implementations. In Special Issue on Multidisciplinary Sciences and Engineering.

Meier, Konrad (2017): Infrastrukturkonzepte für virtualisierte wissenschaftliche Forschungsumgebungen (Doctoral dissertation, University of Freiburg, Freiburg im Breisgau, Germany).

K. Meier, G. Fleig, T. Hauth, M. Janczyk, G. Quast, D. von Suchodoletz, and B. Wiebelt
“Dynamic provisioning of a HEP computing infrastructure on a shared hybrid HPC system.”
Journal of Physics: Conference Series, Volume 762(1):012012, 2016

Meier Konrad, Grüning Björn, Blank Clemens, Janczyk Michael, von Suchodoletz Dirk
"Virtualisierte wissenschaftliche Forschungsumgebungen und die zukünftige
Rolle der Rechenzentren 2017." 10. DFN-Forum Kommunikationstechnologien, 30.-31. Mai 2017, Berlin, Gesellschaft für Informatik eV (GI), Seiten: 145 - 154,
(Sonderpreis auf DNF-Forum Kommunikationstechnologien)

von Suchodoletz Dirk, Wiebelt Bernd, Meier Konrad, Janczyk Michael
"Flexible HPC: bwForCluster NEMO 2017". Proceedings of the 3rd bwHPC-Symposium: Heidelberg 2016, heiBOOKS

2017 IEEE 9th International Conference on Cloud Computing Technology
and Science ViCE Registry: "An Image Registry for Virtual Collaborative Environments"
Christopher B. Hauser, Jörg Domaschka
Institute of Information Resource Management
University of Ulm