Chemotion

Chemotion ist der übergeordnete Name für eine Sammlung von Projekten, die sich mit dem Aufbau von Infrastruktur und der Programmierung von Software für Forschungsdatenmanagement in der Chemie beschäftigen. Der bisherige Fokus der Entwicklungen liegt auf der Entwicklung eines Elektronischen Laborjournals für Chemiker und der Etablierung eines Repositoriums für Forschungsdaten. Die Funktionalität beider Systeme wird durch ergänzende Software-Projekte erweitert. Alle Entwicklungen sind als Open Source verfügbar.

Chemotion-ELN:

Das Elektronische Laborjournal Chemotion ist eine Software zum Management von Forschungsdaten in chemischen Laboren. Die Software wird als Open Source zur Verfügung gestellt, um eine Installation an verschiedenen Universitäten zu ermöglichen und damit eine möglichst breite Community unterstützen zu können. Das Laborjournal ist, im Unterschied zu vielen anderen Laborjournalen, an die speziellen Anforderungen angepasst, die sich in der Chemie ergeben. So können chemische Strukturen durch Struktureditoren angelegt und bearbeitet werden. Typische Datensätze, wie sie durch die Charakterisierung in der Molekülchemie entstehen, werden erfasst und können mit Metadaten versehen werden. Die Software verfügt über Prozessierungsmechanismen für analytische Messdaten, die eine Visualisierung von ausgewählten Datentypen innerhalb des Laborjournals ermöglichen. Eine besondere Funktionalität des ELNs ist die Möglichkeit, Daten aus der eigenen ELN-Forschungsumgebung heraus in ein Repositorium für Forschungsdaten (das Chemotion Repositorium) zu spiegeln und damit eine externe, zentrale Speicherung von Forschungsdaten zu unterstützen.

Chemotion-Repositorium:

Das Chemotion Repositorium wurde zur Speicherung und Offenlegung von Forschungsdaten aus der experimentellen Chemie entwickelt. Das Repositorium kann durch seine Anbindung an das Chemotion ELN sehr einfach genutzt werden und bietet eine Möglichkeit, durch einfache Mechanismen Daten offen bereitzustellen. Das Repositorium bietet den Nutzern eine an chemische Standards angepasste Darstellung der Daten, wodurch ein schneller Überblick über die verfügbaren Datensätze und ein schneller Zugang zu den Ergebnissen ermöglicht werden soll. In die Publikationsprozesse des Repositoriums wurden automatische Prüfungen eingefügt, ein Peer-Review soll darüber hinaus für eine hohe Qualität der Daten sorgen.

Häufig gestellte Fragen:

Wie kann ich die Chemotion Systeme testen oder nutzen? Zur Testung steht ein Demoserver bereit, der für einzelne Testungen verwendet werden kann (https://eln.chemotion.net/home). Für eine Testung durch kleine Gruppen oder auch für eine Nutzung in Praktika, kann eine Instanz am Karlsruher Institut für Technologie genutzt werden. Zur Einrichtung einer eigenen Instanz der Software kann der Sourcecode auf GitHub genutzt werden oder nach Kontaktaufnahme ein alternatives Vorgehen geplant werden.
Kontakt für KIT-Instanz-Nutzung oder Eigeninstallation: nicole.jung@kit.edu .

Sind ELN und Repositorium getrennt voneinander nutzbar? Ja, beide Systeme können jeweils ohne Einschränkung in der Funktionalität ohne das andere verwendet werden.

Welche Weiterentwicklungen sind geplant und kann ich aktiv mitwirken? Eine Weiterentwicklung der Systeme ist vor allen Dingen für die Teildisziplinen der Chemie im Rahmen der NFDI4Chem geplant. Es werden aber auch Anpassungen an Bedarfe in den Materialwissenschaften im Rahmen des Science Data Centers MoMaF vorgenommen. Generische Aspekte fließen in Zukunft unter dem Label SciMotion ELN ein und können für Arbeiten in angrenzenden Fachbereichen genutzt werden.
Jede Art der Mitwirkung ist jederzeit willkommen. Insbesondere eine Erweiterung der Entwicklercommunity kann das Projekt unterstützen und das gemeinschaftliche Vorhaben stärken. Teilnahme an den Entwicklungen in Form einer Nutzung und Erarbeiten von weiteren Anforderungen und Verbesserungen ist ebenfalls erwünscht.

Wo kann ich weitere Informationen erhalten? Informationsmaterial wird über Youtube bereitgestellt. Zusätzliche Beratung, Schulung und Hilfestellung wird über die NFDI4Chem angeboten.